温州医科大学是浙江省省属普通高等学校。学校可溯源至创办于 1912 年的浙江医学专门学校， 1958 年 8 月由浙江医学院从杭州分迁至温州建立，初名“浙江第二医学院”，后以校址所在地改名为“温州医学院”， 2013 年更名为“温州医科大学”， 2015 年成为浙江省政府、国家卫生计生委和教育部共建高校。 2017 年，成为浙江省重点建设高校。
学校 1958 年开始招收五年制本科学生， 1978 年招收硕士研究生，是全国首批硕士学位授予单位，具有博士学位授予权。现有临床医学一级学科博士点，临床医学、护理学、中药学、生物学、生物医学工程、基础医学、中西医结合、药学等 8 个一级学科硕士点， 6 个专业硕士学位授权点；设有临床医学一级学科博士后科研流动站。学校进入 ESI 全球排名前 0.24% （全国第 80 位），临床医学、化学、药理学与毒理学 3 个学科位列 ESI 全球排名前 1% ，其中临床医学专业进入 ESI 全球排名前 0.22% 。拥有 1 个国家工程技术研究中心、 1 个国家重点实验室、 13 个省部级重点实验室（研究中心）、 1 个浙江省“ 2011 协同创新中心”； 2 个浙江省“重中之重一级学科”， 3 个浙江省 A 类一流学科、 7 个 B 类一流学科， 10 个浙江省高校重点学科， 2 个浙江省重点建设学科。
学校坚持以社会需求为导向，以百姓满意为宗旨，着力培养有自信有情怀、能做事能创新的优秀医学人才。学校现有 26 个本科招生专业，涉及医学、理学、工学、管理学等四大学科门类。人才培养质量稳步提升， 2017 年， 18 个本科招生专业在一段线上全部录满，其中 15 个专业投档线居省属本科院校同类专业第一。据浙江省教育评估院调查报告显示，我校 2016 届（毕业后一年）、 2014 届（毕业后三年）本科毕业生职业发展与人才培养质量总排名均位居全省本科院校第一。临床医学类毕业生参加国家执业医师资格考试通过率一直位居全国前 10% 。目前有全日制在校生 16507 人（不含独立学院——温州医科大学仁济学院），其中博士研究生 135 人，硕士研究生 2967 人，学历教育留学生 749 人。学校已形成从本科生到硕士生、博士生及博士后，从全日制到成人教育、留学生和港澳台学生教育全方位、多层次的人才培养体系。
学校现有教职员工及医护人员 10000 余人（含附属医院），其中具有高级专业技术职务 1600 余人。学校本部现有专任教师 1422 人，其中具有正高级专业技术职务 349 人，具有副高级专业技术职务 462 人，博士学位 813 人。一批优秀教师入选国家“千人计划”、国家“万人计划”、“长江学者奖励计划”、国家“百千万人才工程”、国家有突出贡献中青年专家、教育部“新世纪优秀人才支持计划”、国家卫生计生委有突出贡献的中青年专家、省特级专家、省“千人计划”、省高校特聘教授等高层次人才；教师荣获“全国优秀教师”“全国师德标兵”“全国三八红旗手”“全国卫生计生系统先进个人”，“眼视光学院教师团队”入选首批全国高校黄大年式教师团队等荣誉。学校获评省重才爱才先进单位。
温州医科大学于 1993 年获批招收外国留学生资格， 2006 年 4 月成立国际教育学院，成建制招收以英语为教学语言的医学专业学历留学生。 2007 年被教育部批准为首批招收本科临床医学专业（英语授课）来华留学生的高等学校。 2008 和 2013 年两度被评为 “ 浙江省高校外国留学生教育工作优秀单位 ” 。 2009 获得全国 “ 来华留学生教育先进集体 ” 荣誉称号，于 2014 年再次获此殊荣。 2011 年获批接受中国政府奖学金来华留学生。 2015 年在浙江省高校外国留学生招生网站评比中荣获优秀奖。
温州医科大学现已成为浙江省规模最大的对外医学教学机构之一，现设有临床医学（ MBBS ）、口腔医学（ BDS ）、药学（全国首家、 2015 年首次招生）、影像学、护理学五个留学本科生专业（授予学士学位），面向全球招生，现有 755 名来自亚、非、欧、美、澳等五大洲 56 个国家的学历留学生和 100 余名来自全球十多所合作院校的短期交换生，其中临床医学（ MBBS ）、口腔医学（ BDS ）和药学三个本科专业，采用全英语授课。 2016 年，获教育部国际司批准，学校与波兰卢布林医科大学共建华佗项目，暂挂靠国际教育学院，下设国际临床医学项目（ MBBS ），采取 “1+3+2” 的中外联合培养模式，开启了学校境外合作办学的新纪元。从 2013 年 9 月起开始面向全球招收研究生，目前有硕士生 32 名，硕博连读生 15 名，博士生 7 名， 2014 年起设立校级奖学金项目，资助世界各国学生来校学习，攻读硕、博学位。此外，学校每年还接纳数十名孔子学院奖学金生来校学习汉语与中国文化。学校还致力于加强与世界各国教育文化交流合作，分别与泰国东方大学和纽约州立大学视光学院合作建设孔子学院。在海外开展汉语教学和中外教育、文化等方面的交流与合作。