新疆大学是国家留学基金委公派出国留学项目受理单位，是上海合作组织大学、中国政府奖学金自主招生、国际中文教师奖学金和自治区人民政府接收周边国家留学生奖学金项目学校。学校先后与 27 个国家和地区的 80 多所高校和教育科研机构签署了教育交流与科研合作协议（备忘录）。在吉尔吉斯斯坦、俄罗斯设立 3 所孔子学院。建有新疆大学俄语中心和俄罗斯对外俄语等级考试考点，在俄罗斯、哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦等国多所大学设有实习基地。